２０日午前、秋田県や新潟県を中心に大雨に見舞われ、秋田新幹線や信越線、羽越線などで運転を見合わせている。午前７時までの２４時間降水量は、秋田市で１１２ミリ、秋田県由利本荘市で１０５・５ミリ、横手市で１１１ミリ、新潟県上越市で４４・５ミリなど。
ＪＲ東日本によると、秋田新幹線は秋田発東京行き「こまち６号」などが運休したが、こまち１０号以降は運転を再開した。山形新幹線は、新庄発東京行きの「つばさ１２８号」と山形発新庄行きの「つばさ１７１号」が村山―新庄間で区間運休となった。在来線では、信越線が長岡―新潟間で始発から午後２時まで上下線で運転を見合わせるほか、羽越線は新津―新発田間が午後１時まで、新発田―村上間が午後２時まで上下線で運転を見合わせ、村上―酒田間では運休や遅れが発生している。