台風6号の接近に伴い、JR東日本の一部の路線や特急列車で終日運転を見合わせるなど、首都圏を中心に運行に大きな影響が出ています。運休などが出ている路線をまとめました。（3日午後1時現在）
■東海道線 東京～熱海間
始発から上野東京ラインへの直通を取りやめ 東京駅で折り返し運転（直通運転再開未定）
（始発から運転を取りやめていた小田原～熱海間は正午すぎに運転再開）
■伊東線 全線
終日運転取りやめ
■横須賀線
横須賀～久里浜間運転見合わせ 再開未定
総武快速線への直通運転中止
■中央本線 高尾～富士見間
始発から午後3時頃まで運転取りやめ
■青梅線 青梅～奥多摩間
始発から午後8時頃まで運転取りやめ
■八高線 寄居～高麗川間
終日運転取りやめ
八王子～高麗川間
川越線への直通運転中止
■川越線 川越～高麗川間
八高線への直通運転中止
■宇都宮線
始発から東海道線への直通運転を中止
東京～上野間で運休
■高崎線
始発から東海道線への直通運転を中止
東京～上野間で運休
■湘南新宿ライン
池袋～逗子駅間の宇都宮線・横須賀線の直通する列車
大宮～小田原駅間の高崎線・東海道線の直通する列車
いずれも始発から運転取りやめ
■上野東京ライン
始発から東海道線と高崎線および宇都宮線との直通運転を中止
上野～東京間運休（再開見込み未定）
※常磐線との直通列車は通常通り直通運転
■常磐線
土浦～勝田間 正午頃から午後4時頃は通常の5割程度で運転
勝田～原ノ町間 正午頃から終日運転取りやめ
■水戸線 全線
午前10時頃から終日運転取りやめ
■水郡線
水戸～常陸大子間、上菅谷～常陸太田間 正午頃から終日運転取りやめ
常陸大子～郡山間 午前11時頃から午後6時頃まで運転取りやめ
■京葉線
武蔵野線への直通運転を中止
■武蔵野線
京葉線への直通運転を中止
■総武快速線
横須賀線への直通運転中止
■内房線
千葉～君津間 通常の7割程度で運転
君津～安房鴨川間 終日運転取りやめ
■外房線
千葉～上総一ノ宮間 通常の6割程度で運転
上総一ノ宮～安房鴨川間 終日運転取りやめ
■総武本線
千葉～佐倉間 通常の9割程度で運転
佐倉～銚子間 終日運転取りやめ
■成田線
佐倉～成田空港間 通常の9割程度で運転
成田～銚子間 終日運転取りやめ
我孫子～成田間 終日運転取りやめ
■鹿島線 全線
終日運転取りやめ
■久留里線 全線
終日運転取りやめ
■烏山線
終日運転取りやめ
■小海線 小淵沢～中込間
終日運転取りやめ
【特急列車】
■「踊り子」「サフィール踊り子」
全列車運休
■「あずさ」
始発から上下計18本運休
下り33号（新宿午後3時発松本行）、上り38号（白馬午後1時43分発新宿行）から運転再開予定
（※新宿～千葉間区間運休の列車あり）
■「かいじ」
始発から上下計16本運休
下り35号（新宿午後3時30分発甲府行）、上り36号（甲府午後3時15分発新宿行）から運転再開予定
（※東京～新宿間区間運休の列車あり）
■「富士回遊」
全列車運休
■「ひたち」
午後は全列車運休
■「ときわ」
品川～勝田間で通常通り運転（64・73・77・81号は勝田～高萩間区間運休）
■「成田エクスプレス」
始発から午後3時頃まで運休（運行予定の45号は新宿～東京駅間区間運休）
■「さざなみ」
全列車運休
■「わかしお」
全列車運休
■「しおさい」
全列車運休
■「草津・四万」
全列車運休
■「あかぎ」
全列車運休
■「きぬがわ」
全列車運休
■「スペーシア日光」
全列車運休
山手線や中央線など、ほかの在来線の路線についても、大幅な遅れや一部運休が発生しています。
東北・上越・秋田・山形の各新幹線は平常通り運行しています。北陸新幹線は午前中に発生した送電設備の故障の影響で一部列車に遅れが出ています。
JR東日本は最新の運行状況を確認してほしいと呼びかけています。