日本航空機と海上保安庁機の衝突事故を受け、日航と全日本空輸は４日、羽田空港を発着する便を中心に国内線の計１３１便の運航を取りやめる。機材の不足や事故の起きた羽田空港のＣ滑走路が閉鎖されている影響が続いており、４日は両社で約２万８０００人に影響が出る見通しだ。
日航は計６６便、全日空は計６５便が欠航すると発表した。スカイマークも欠航や大幅な遅延の可能性があるとして、最新の運航状況をホームページで確認するように呼びかけている。
欠航が続いていることを受け、ＪＲ各社は４日、新幹線を増便する。ＪＲ東日本は北陸と北海道・東北、ＪＲ西日本は山陽新幹線で臨時列車を運行しており、航空各社は新幹線の利用も検討するように促している。